Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp19Q3UJD6 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp19Q3UJD6 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp19Q3UJD6 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp19Q3UJD6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms