Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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