Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms