Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp4P35123 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp4P35123 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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