Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Q1O19441 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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H2-Q1O19441 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms