Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmf1B9EKI3 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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