Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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