Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atg3Q9CPX6 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms