Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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