Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shq1Q7TMX5 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shq1Q7TMX5 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms