Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms