Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-212ENSMUST00000174001 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1029 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Lcp1-202ENSMUST00000124499 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm15342-201ENSMUST00000146222 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pdik1l-202ENSMUST00000105876 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Thnsl1-201ENSMUST00000054591 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm12003-201ENSMUST00000118518 1105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cysrt1-203ENSMUST00000186719 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rps7-ps1-201ENSMUST00000211928 391 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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