Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms