Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12983-201ENSMUST00000120974 310 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms