Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nphp4P59240 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms