Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Btnl10-201ENSMUST00000020792 1028 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tssk4-207ENSMUST00000228395 1273 ntAPPRIS P5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28451-201ENSMUST00000189311 2560 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44610-201ENSMUST00000209012 3827 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16223-201ENSMUST00000087332 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Dnajc5b-204ENSMUST00000165693 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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