Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16494-201ENSMUST00000165525 261 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms