Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TtrP07309 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TtrP07309 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms