Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Samt1A2BED8 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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