Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm5538W4VSP6 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm5538W4VSP6 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms