Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms