Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Usp47Q8BY87 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Usp47Q8BY87 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Usp47Q8BY87 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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