Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms