Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NischQ80TM9 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms