Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ssxb3Q6XAS4 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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