Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15646-201ENSMUST00000143317 766 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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