Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms