Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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NcanP55066 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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NcanP55066 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NcanP55066 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NcanP55066 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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