Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms