Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms