Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Glt8d2-202ENSMUST00000065815 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr685-201ENSMUST00000051355 1088 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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