Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChfrQ810L3 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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