Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Il12b-201ENSMUST00000102796 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Prune2-207ENSMUST00000225351 2115 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mgl2-201ENSMUST00000041550 1586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Stx16-202ENSMUST00000087908 3865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Sytl3-205ENSMUST00000160483 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm10120-201ENSMUST00000219845 357 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms