Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms