Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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