Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms