Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms