Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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