Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Hrh4-201ENSMUST00000041676 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14609-201ENSMUST00000122176 902 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 AC132247.1-201ENSMUST00000225930 585 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfm5-201ENSMUST00000051137 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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