Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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