Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm6723-201ENSMUST00000180449 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm26703-202ENSMUST00000181506 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms