Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ercc8Q8CFD5 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms