Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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