Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Hp1bp3-203ENSMUST00000105825 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Enox2-205ENSMUST00000114918 3226 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Tnfsf8-201ENSMUST00000030047 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC154300.1-201ENSMUST00000219735 2627 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm45025-201ENSMUST00000206043 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm12983-201ENSMUST00000120974 310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms