Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Top2aQ01320 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Top2aQ01320 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Top2aQ01320 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Top2aQ01320 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Top2aQ01320 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Top2aQ01320 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top2aQ01320 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top2aQ01320 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top2aQ01320 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Top2aQ01320 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Top2aQ01320 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Top2aQ01320 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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