Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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SgcgP82348 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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SgcgP82348 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SgcgP82348 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SgcgP82348 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SgcgP82348 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SgcgP82348 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms