Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms