Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Nqo1-201ENSMUST00000003947 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Chrna5-201ENSMUST00000093844 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms