Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Nup155Q99P88 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nup155Q99P88 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms