Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Trappc12Q8K2L8 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Trappc12Q8K2L8 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Trappc12Q8K2L8 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Trappc12Q8K2L8 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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